“国防部”委托“中科院”研发的单兵“简易型定位导引防护器”功能言过其实，批评军方把纳税人当傻瓜，她并主导提案冻结相关采购预算。

《联合晚报》报导，陆军于97年委托“中科院”来研发单兵操作简易型定位导引防护器，花费4910万元，声称具备干扰军规美国GPS、俄罗斯GLOONASS与中共北斗定位导航系统的能力，让敌人的导弹打偏或迷路。

报导指出，马文君日前在立法院外交及国防委员会中提出质疑，指该防护器对美、俄、中的定位系统都不具干扰能力，形同“废品”，军方明年却仍要编列数亿元采购这项装备。

马文君说，我方宣称拟干扰的导航系统都是中、美、俄耗费巨资研发出来的，“哪有这么容易被干扰破解？”她认为“中科院”可以继续研发改进，寻求破解之道，但军方不用急着买。

“中科院”的说法是，我方已取得干扰中共北斗卫星导航系统相关频率和参数，有能力干扰中共巡航导弹，但事涉敏感，若公开说明运作原理，对方就会知道我方战备能量所在，因此不便公开说明，将私下向立委报告，让预算过关。